Prenascan
Informace o způsobu vyšetření a rozsah vyšetření
Princip vyšetření
PRENASCAN patří do skupiny krevních genetických neinvazivních prenatálních testů (NIPT), které mezi 10. až 26. týdnem těhotenství vyšetřují DNA plodu volně kolující v mateřské krvi (cffDNA). NIPT je většinou zaměřeno na ztráty (delece) nebo zmnožení (duplikace) bloků genů a změny počtu (aneuploidie) párových organizačních jednotek genů – chromozomů. Trizomie označuje nadbytečný, třetí chromozom,
Hlavním zdrojem cffDNA je placenta spojující matku s plodem a zajišťující jeho výživu a látkovou výměnu. Placenta a plod mají geneticky shodný základ - vznikají z oplozeného vajíčka. Buňky placenty se neustále dělí a odumírají a při tom se do mateřského krevního oběhu uvolňují úlomky (fragmenty) DNA plodu, které se mísí s volně kolujícími fragmenty DNA matky.
Fetální frakce
Fetální frakce (FF) je podíl volné DNA plodu vůči celkovému obsahu volné DNA v krvi matky. Obvyklá dolní hranice FF při které je ještě možno vydat výsledek je FF 4%.
Metodika PRENASCAN ale umožňuje vydávat výsledky i při nižších hodnotách FF. Nízká FF může být známkou nižší aktivity placenty a rizikovým znakem pro další průběh těhotenství (například riziko nižší porodní hmotnosti).
Metodika testu
Automatizovaný postup: spolehlivý výsledek
Záměna vzorku u automatizované linky pro test PRENASCAN nehrozí.
Test PRENASCAN využívá CE-IVD a IVDR certifikovanou technologii VeriSeq NIPT v2 Solution (Illumina Inc., USA).
CE-IVD a IVDR certifikace metody splňuje vysoké požadavky EU na kvalitu a bezpečnost laboratorních diagnostických testů, které se používají pro detekci, diagnostiku a monitorování různých onemocnění.
Rozsah vyšetření
PRENASCAN test je založen na analýze dat celého genomu, nejen vybraných oblastí.
Test PRENASCAN je validován pro:
-
Aneuploidie (odchylky v počtu) všech chromozomů plodu, včetně těch vzácných. Mezi nejzávažnější aneuploidie patří:
-
změny v počtu nepohlavních chromozomů:
- Trizomie chromozomu 21 (Downův syndrom), Trizomie chromozomu č. 18 (Edwardsův syndrom), Trizomie chromozomu č. 13 (Patauův syndrom), Trizomie chromozomů č. 9, 16 a 22 zvyšujících riziko spontánního potratu.
-
změny v počtu pohlavních chromozomů X a Y:
- Turnerův syndrom (monozomie X), Klinefelterův syndrom (trizomie XXY), Triple X syndrom (XXX) a Syndrom Jacobsové (XYY).
- Vzácné chromozomální odchylky (aneuploidie všech ostatních chromozomů), které zodpovídají za významnou část všech závažných prenatálních nálezů.
-
změny v počtu nepohlavních chromozomů:
- Detekci částečných delecí a duplikací o velikosti minimálně 7Mbp u všech autosomů.
Výsledky testu PRENASCAN ještě navíc analyzujeme vlastní bioinformatickou analýzou, která umožňuje v závislosti na povaze konkrétního vzorku (výška FF atp.) analyzovat i malé částečné delece a duplikace (také mikrodelece a mikroduplikace) s velikostí pod 7 Mbp, včetně např. syndromu DiGeorge a dalších (viz Tabulka 3).
Vzácné chromozomální aneuploidie a částečné delece a duplikace jsou často omezeny na placentu a mohou být rizikovým znakem pro další průběh těhotenství. U plodu se potvrzují v méně než polovině případů. V některých případech je nalezená chromozomální odchylka mateřského původu.
Test neananalyzuje definované regiony. Seznam těchto regionů v dokumentu VeriSeq NIPT Solution v2 Excluded Regions File (illumina.com).
| T21 (Downův syndrom) | T18 (Edwardsův syndrom) | T13 (Patauův syndrom) | |
|---|---|---|---|
| Senzitivita | >99.9% | >99.9% | >99.9% |
| Specificita | 99.90% | 99.90% | 99.90% |
| Chromozomální aneuploidie a doprovodné nálezy | Vzácné aneuploidie nepohlavních chromozomů | Částečné delece a duplikace chromozomů (≥7Mb) | |
|---|---|---|---|
| Senzitivita | 95.5% | 96.4% | 74.1% |
| Specificita | 99.3% | 99.8% | 99.8% |
Příklad syndromů způsobených částečnými delecemi/duplikacemi
| 18q deletion Syndrome | 10q deletion Syndrome | Jacobsen Syndrome |
| 14q11-q22 deletion Syndrome | 2q33.1 deletion Syndrome | 15q26 overgrowth Syndrome |
| 5q21.1-q31.2 deletion Syndrome | Wolf-Hirschhornův syndrome (4p deletion) | 8p23.1 duplication/deletion Syndrome |
| Monosomy 9p Syndrome | Cri du Chat (5p deletion)Syndrome | 22q11 (incl. DiGeorge syndrome) |
| Langer-Giedion Syndrome (LGS) | Cat-eye Syndrome (CES) | 11q11-q13.3 duplication Syndrome |
Pohlaví plodu
PRENASCAN detekuje pohlaví plodu na základě přítomnosti fragmentů DNA příslušných k mužského chromozomu Y.
Poznámka k vyšetření:
Ať už si přejete referovat pohlaví plodu nebo ne, test PRENASCAN provede analýzu změn počtu (aneuploidií) pohlavních chromozomů X a Y pro karyotypy XO (Turnerův syndrom), XXX (Triple X syndrom), XXY (Klinefelterův syndrom) a XYY (Syndrom Jacobsové). Zvýšeného riziko těchto syndromů bude ve zprávě PRENASCANu vždy uveřejněno.
| Shoda klasifikace pohlaví plodu pomocí metody využívané testem PRENASCAN s klinickou referencí | |||
|---|---|---|---|
| Procentuální shoda | 100% XX | 100% XY | 90.5% XO |
| 100% XXX | 100% XXY | 91.7% XYY | |
Pohlaví u dvojčat
- Stanovení pohlaví: u dvojčat je analýza pohlavních chromozomů omezena na stanovení přítomnosti chromozomu Y. V případě průkazu fragmentů příslušných k chromozomu Y PRENASCAN nedokáže rozlišit, zda jsou obě dvojčata mužského pohlaví (jde o bratry) anebo jde o bratra a sestru.
- Rozsah vyšetření: pacientka si u testu PRENASCAN může zvolit, zda chce provést pouze základní analýzu zaměřenou na rizika pro trizomie chromozomů 21, 18, 13, anebo analýzu všech nepohlavních chromozomů a jejich částečných chromozomálních aneuploidií (delece a duplikace části chromozomů). U dvojčat není možné provést analýzu aneuploidií pohlavních chromozomů (např. Turnerův syndrom s karyotypem X0).
- I když nastavení algoritmů pro vyšetření dvojčat je složitější než v případě jednočetných těhotenství, je přesnost PRENASCANu u dvojčat srovnatelná s přesností u jednočetných těhotenství. Doporučujeme výsledky NIPT u dvojčat hodnotit spolu s dalšími metodami prenatální péče, hlavně ultrazvukovým vyšetřením.
| T21 (Downův syndrom) | T18 (Edwardsův syndrom) | T13 (Patauův syndrom) | |
|---|---|---|---|
| Senzitivita | >99.9% | >99.9% | NA |
| Specificita | >99.7% | >99.7% | >99.7% |
Syndrom mizejícího dvojčete
Pokud po oplození dvou zárodků jeden z nich v raném stadiu těhotenství zanikne a vyvíjí se dále pouze jeden plod, mluvíme o Syndromu mizejícího dvojčete. Zánik jednoho zárodku je dokumentován ultrazvukovým vyšetřením a nemusí jej doprovázet žádné komplikace v dalším průběhu těhotenství. Fragmenty DNA zaniklého dvojčete mohou zůstat po určitou dobu v krevním oběhu matky a být příčinou falešně pozitivního výsledku NIPT nebo nesprávného určení pohlaví. V takovém případě je vyšetření možné pouze tehdy, pokud byl zánik druhého zárodku do 8. týdne gravidity a odběr krve proveden až za 8 týdnů poté. I tak přetrvává až 5% riziko falešné pozitivity. Dotaz na Syndrom mizejícího dvojčete je součástí žádanky o PRENASCAN.
Genetické rozdíly mezi placentou a plodem a jejich vliv na výsledek NIPT
I když je genetický základ plodu a placenty shodný, přibližně u 2% těhotenství vznikají v prvních týdnech těhotenství rozdíly v genetické výbavě plodu a placenty, které označujeme jako mozaicismus. Protože cffDNA pochází z placenty, mohou změny omezené jen na části placenty (placentální mozaicismus) vést k falešně pozitivním výsledkům a naopak porucha omezená jen na buňky plodu (fetální mozaicismus) k falešně negativním výsledkům NIPT. Proto doporučujeme každý pozitivní výsledek PRENASCANu ověřit přímým vyšetřením tkáně plodu získané odběrem plodové vody (amniocentézou). Negativní výsledek PRENASCANu by měl být doplněn ultrazvukovým vyšetřením ve 20. týdnu těhotenství.
Chimérismus
Chimérismus matky je stav, kdy má žena v těle dvě nebo více geneticky odlišných buněčných linií. Tento jev, stejně jako fetoplacentální mozaicismus (viz výše), může mít vliv na výsledky neinvazivního prenatálního testování (NIPT) (zkreslení pohlaví, falešně pozitivní i negativní výsledek).
Upozornění na obecné limitace testů NIPT
Kromě syndromu mizejícího dvojčete, fetoplacentálního mozaicismu a chimérismu mohou výsledek NIPT testu zkreslit i další faktory, jako je užívání heparinu a jeho analog, podíl fetální frakce a další. Komplexní informace o vyšetření viz Informovaný souhlas PRENASCAN. PRENASCAN test je screeningový test, proto jeho závěry musí být konzultovány s odborníkem s přihlédnutím k výsledkům ostatních vyšetření. Pozitivní výsledek z testu PRENASCAN musí být vždy potvrzen diagnostickým testem. Negativní výsledek PRENASCANu by měl být doplněn ultrazvukovým vyšetřením ve 20. týdnu těhotenství.
Důležitost zařazení NIPT do komplexní péče o pacientku v těhotenství
Výsledky genetických, biochemických a ultrazvukových vyšetření se navzájem doplňují a jejich kombinace dává nejvyšší možnou míru bezpečí pro pacientky a jejich plod.
Nejvyšší spolehlivost zabezpečují komplexní programy pro péči o těhotnou pacientku.
Srdeční akce plodu
Ultrazvukové transvaginální vyšetření
Biochemické vyšetření v I. trimestru
Vyšetření PAPP-A, free β hCG, PIGF (doporučené datum odběru je od 11+0 v jakékoli laboratoři včetně GENNET)
Screening v I. trimestru
včetně měření NT (nuchální translucence), výpočtu rizika komplikací v těhotenství – preeklampsie, růstová restrikce, předčasný porod, podrobné zhodnocení morfologie plodu (odběr v 12.-13. týdnu těhotenství)
Test PRENASCAN
Odběr probíhá mezi I. trimestrem a 22. týdnem
Podrobná morfologie plodu
Ultrazvukové vyšetření ve 20.-22. týdnu gravidity
Existují i další komplexní programy pro péči o těhotnou pacientku jako např. BabyVision+, kdy se provádí UZ transvaginální vyšetření a PRENSACAN již v 10. týdnu.
